La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est connue comme un trouble de paralysie progressive caractérisé par une dégénérescence des motoneurones supérieurs et inférieurs et a une durée de survie moyenne de trois à cinq ans. De plus en plus de preuves suggèrent le lien bidirectionnel entre le microbiote intestinal et la neurodégénérescence. Ici, nous visons à rapporter un cas féminin atteint de SLA qui a bénéficié d’une transplantation de microbiote lavé (WMT), une transplantation de microbiote fécal (FMT) améliorée, via un tube entéral transendoscopique au cours d’un suivi de 12 mois. Il est à noter que le traumatisme accidentel du cuir chevelu que le patient a subi plus tard a été traité avec des antibiotiques prescrits qui ont provoqué une détérioration de la SLA. Les WMT de sauvetage qui ont suivi ont stoppé avec succès la progression de la maladie avec une amélioration rapide. Les plateaux et les inversions se sont produits pendant tout le cours du WMT. Les échantillons de selles et de sang du premier au dernier WMT ont été collectés pour une analyse dynamique microbienne et métabolomique. Nous avons observé la tendance changeante microbienne et métabolomique compatible avec l’état de la maladie. Ce rapport de cas montre pour la première fois les preuves cliniques directes de l’utilisation du WMT pour le traitement de la SLA, indiquant que le WMT pourrait être la nouvelle stratégie de traitement pour contrôler cette maladie dite incurable.